在计划经济体制下，水利资金的运动过程同样遵循项目资金运动的共同规律，包括上述五个过程，只不过每一过程都是政府行为，都带有浓重的计划色彩。一是在前期工作阶段，项目规划、立项的决策等一系列前期工作均由政府包揽，资金由政府筹集，并且对水利资金的概念认识狭窄，只计算货币资金，而对大量无偿性农民投劳不折算成资金，从而人为地缩小了水利资金的实有投入规模，不能真实地反映水利项目建设的成本。二是在施工建设阶段，水利资金配置给建设单位使用，如需突破资金计划，再追加资金的投入。三是在水利项目运营阶段，对水利项目的营运成本费用不进行完整的成本核算，对水利固定资产不提或少提折旧，水管单位不讲求自身经济效益而只讲社会效益。四是在回收补偿过程中，水管单位无权根据市场状况决定商品水和其他服务的价格，而只能由政府确定收费标准，甚至于政府可以确定不收水费，水管单位没有明确的经济权利与责任，从而使水管单位普遍处于低效生产状态。五是在分配过程中，实行侵蚀性的分配，一切结余都要上缴国家。

可见，在计划经济体制下，水利资金并不能实现有效的增值，从而也就无法保证水利资金的运动步入自我积累、自我发展的良性循环。